β-Thal Modifier StripAssay® firmy ViennaLab to zestaw diagnostyczny CE-IVD przeznaczony do identyfikacji genotypów związanych z ciężkością przebiegu β-talasemii. Test opiera się na amplifikacji PCR oraz hybrydyzacji odwrotnej na paskach StripAssay®.
W przeciwieństwie do paneli wykrywających bezpośrednio mutacje genu β-globiny, β-Thal Modifier StripAssay® analizuje wybrane polimorfizmy genetyczne, które mogą modyfikować fenotyp choroby, m.in. poprzez wpływ na poziom hemoglobiny płodowej (HbF). Takie informacje mogą uzupełniać diagnostykę molekularną β-talasemii i wspierać interpretację różnic w obrazie klinicznym pacjentów.
Zestaw obejmuje 5 loci polimorficznych w regionach/genach HBG2, BCL11A oraz HBS1L-MYB:
- HBG2 g.-158 C>T / XmnI G-gamma — c.-211C>T
- BCL11A rs1427407 G>T — c.386-22075A>C
- BCL11A rs10189857 A>G — c.386-17267T>C
- HBS1L-MYB rs28384513 A>C — c.-380A>C
- HBS1L-MYB rs9399137 T>C
Analizowane warianty są związane z genetyczną modulacją ekspresji hemoglobiny płodowej oraz mogą mieć znaczenie w ocenie zmienności fenotypowej β-talasemii.
β-talasemia jest dziedzicznym zaburzeniem syntezy hemoglobiny, którego obraz kliniczny może być bardzo zróżnicowany. U pacjentów z podobnymi mutacjami genu β-globiny nasilenie objawów może różnić się w zależności od dodatkowych czynników genetycznych, w tym wariantów wpływających na poziom HbF.
Podwyższony poziom hemoglobiny płodowej może łagodzić przebieg części hemoglobinopatii, dlatego analiza wariantów w regionach HBG2, BCL11A i HBS1L-MYB może stanowić uzupełnienie klasycznej diagnostyki β-talasemii.
Wynik badania powinien być interpretowany łącznie z rozpoznaniem molekularnym mutacji β-globiny, obrazem klinicznym, morfologią krwi, profilem hemoglobiny, poziomem HbF, wywiadem rodzinnym oraz innymi wynikami diagnostycznymi.
Technologia ViennaLab StripAssay® obejmuje izolację DNA, amplifikację PCR z użyciem biotynylowanych starterów oraz hybrydyzację produktów PCR z allelospecyficznymi sondami unieruchomionymi na pasku testowym. Związane sekwencje są wykrywane z użyciem streptawidyny sprzężonej z fosfatazą alkaliczną oraz substratów barwnych.
Dla każdej próbki wykonywana jest jedna reakcja PCR, a wynik odczytywany jest na jednym pasku testowym. Układ linii pozwala określić genotyp dla każdego z analizowanych loci.
| Cecha | Specyfikacja |
|---|
| Metoda analityczna | PCR + reverse-hybridization |
| Technologia | ViennaLab StripAssay® |
| Materiał badany | DNA izolowane z krwi pełnej |
| Geny / regiony docelowe | HBG2, BCL11A, HBS1L-MYB |
| Obszar diagnostyczny | β-talasemia, modyfikatory przebiegu choroby, HbF |
| Liczba analizowanych loci | 5 |
| Zakres DNA do PCR | 2–10 ng/µl |
| Liczba reakcji PCR na próbkę | 1 |
| Liczba pasków na próbkę | 1 |
| Liczba testów | 20 |
| Temperatura przechowywania | 2–8°C |
| Status produktu | CE-IVD |
Uwaga techniczna: zgodnie z IFU do wykonania oznaczenia wymagana jest polimeraza Taq DNA Polymerase jako materiał dodatkowy niewchodzący w skład podstawowego zestawu.
Zestaw obejmuje polimorfizmy w regionach HBG2, BCL11A oraz HBS1L-MYB, które mogą wpływać na fenotyp pacjenta.
Test nie zastępuje paneli wykrywających mutacje HBB, ale dostarcza dodatkowych informacji przydatnych w interpretacji ciężkości choroby.
Analizowane loci są powiązane z regulacją poziomu hemoglobiny płodowej, istotnej w przebiegu β-talasemii i innych hemoglobinopatii.
Dla jednej próbki wykonywana jest jedna reakcja PCR i jeden pasek testowy, co upraszcza workflow laboratoryjny.
Połączenie PCR i hybrydyzacji paskowej pozwala na czytelną interpretację wyniku na podstawie wzoru prążków.
